静安寺迁至今址后，规模逐渐扩大，至元时，蔚成巨刹。寺内有8处名胜，即：三国时所立“赤乌碑”、南北朝时所植“陈朝桧”、原于神僧智严异行而流传的“虾子潭”、南宋仲依所建“讲经台”、沸井浜中突沸的“涌泉”、诗僧寿宁所筑方丈室“绿云洞”、行人取道渡吴淞江的古渡口“芦子渡”、东晋遗存防御海寇的“沪渎垒”。元代周弼《寺记略》 、清代嘉庆《松江府志》、同治《上海县志》和《法华乡志》均有附载，今按《法华乡志》：“华亭东北百里，松江绕焉。有寺在沪渎，曰重玄。大中祥符元年，因避讳改今额为静安。

明洪武二年（1369年），铸洪武大钟，耗铜六千斤，上有“洪武二年铸，祝皇太子千秋”铭文，声洪震远。

清初以来，静安寺屡经兴废。清乾隆六年（1741年），礼部侍郎麦焕出资重修大殿。乾隆四十三年（1778年），歙人孙思望倡议捐资重修殿堂。寺僧大海，曾将寺内被火焚余的宋代银杏树干，雕成十八尊罗汉及一尊韦驮像于寺内供奉。咸丰同治年间，静安寺毁于太平天国战火，唯余一座大住持殿。清同治年间（1862～1874年），仅存1座大殿。光绪初年，大殿塌记。清光绪六年（1880年），在鹤峰法师的住持下，重建静安寺，翌年四月初八寺宇落成。自此形成有名的一年一度静安寺庙会。光绪九年（1883）由李朝观作记、住持鹤峰勒碑，《重建静安寺记》碑文今仍保存于大雄宝殿前壁。

民国元年（1912年），第一个全国性佛教组织——中华佛教总会成立，会址设于静安寺，著名爱国诗僧寄禅法师（八指头陀）任会长。次年，寄禅为保护全国寺庙财产，赴京请愿未果，不幸圆寂于北京法源寺。

民国二年（1913年）3月，中华佛教总会在静安寺开首次全国代表大会，会议推选冶开法师、熊希龄为会长，清海法师为副会长，圆瑛法师为参议长。

民国八年（1919年），寺前填浜扩路，筑成通衢，命名为静安寺路（即今南京西路）。

民国九年（1920年），寺僧常贵会同沪绅姚文栋等人在大殿东兴建三圣殿，基本形成寺院之主体格局。

抗战胜利后，在住持德悟、监院密迦主持下，在原山门之东，另建一座仿唐新山门，由邓散木（铁翁）题额“静安古寺”。在山门前竖立一座古印度阿育王式梵幢，成为静安寺标志。在此期间，静安寺还于寺后创办静安小学，于南翔建立静安农村实验学校。两校经费均同静安寺负担。